益生菌在电视广告中随处可见，益生菌颗粒、益生菌药品、保健品，尤其是许多酸奶产品会把益生菌作为卖点，例如：养乐多、优益C等，宣称可以帮助肠道运动，促进身体健康。
在过去十年，有超过500种益生菌食品及饮料产品推出，中国高级乳业分析师、新华社特约经济分析师宋亮表示，2017年中国益生菌市场为50亿欧元，预计未来五年能到100亿欧元，市场潜力大。
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但最近，以色列魏茨曼科学研究所的数据表明，益生菌并非适用于改善所有人的健康状况，存在个体差异，这无疑是对蓬勃发展的益生菌市场的当头棒喝。
魏茨曼免疫学博士Eran Elinav表示：有关益生菌的文献一直存在争议，为了验证益生菌的功效，他们做了两项研究。
在第一项研究者中：有25名志愿者接受肠镜检查，以取样他们肠道区域的基本微生物群。其中15名志愿者被分成两组，第一组服用普通益生菌，而第二组服用安慰剂。两组都进行了第二轮上镜和结肠镜检查，以评估他们的内部反应，随后又进行两个月的随访。结果显示，虽然益生菌在某些人的胃肠道中占据了一席之地，但在另一些人的肠道中益生菌却被其他菌群赶出去了。
Eran Elinav表示：益生菌的定居模式高度依赖于个体，“人人都能从超市购买的益生菌产品中受益”这种想法是错误的。
在第二项研究者中：研究人员给21名志愿者服用了相同疗程的抗生素，然后被分为三组，第一组是让他们自己恢复，第二组是给他们服用益生菌，第三组则是给他们使用微生物移植，用他们在使用抗生素之前原有的菌群进行治疗。结果显示，在抗生素清除后，益生菌很容易在第二组人的肠道中定居，但其原有的健康菌群系统用了长达6个月的时间才恢复，即益生菌造成了肠道微生物系统混乱，而通过微生物移植治疗的那一组中，肠道微生物群在几天内就恢复了正常。
Elinav说：虽然没有测量长期微生物群紊乱对临床的影响，但先前的研究发现肠道微生物破坏与肥胖、过敏和炎症之间存在联系。现在有很多人觉得益生菌对人体无害并且有益健康，但本次实验结果跟这个观点恰好相反，益生菌和抗生素联合使用会产生新的副作用，可能带来更长期的隐患。
公众对益生菌的功效应当客观看待，不应期待过高，不要抱着“只要是益生菌都能治病”的想法，随意去买益生菌制品，应寻求医生帮助个体化定制治疗方案。
