青霉素类抗菌药物与头孢菌素类抗菌药物是临床应用最多的两类抗菌药物。两者的作用机制都是干扰细胞壁的合成，使细菌不能生长繁殖。那么两者有什么区别呢？
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青霉素类耐药率高于头孢菌素类。青霉素经过几十年的使用，耐药性已经越来越强，对很多细菌已经不敏感，导致使用面越来越窄。不是药不行了，而是病菌生存的环境变了。
青霉素类易过敏。青霉素在进行治疗之前，医生会反复确定患者，有没有对青霉素产生过敏的，有的话肯定就不能打了，有时候为了确定，还不得不进行皮试。即使严格按要求做了皮试，但有些患者会出现“迟发”反应，一旦抢救不及时，可能会引起过敏性休克性死亡。头孢类的药物可能就比青霉素要相对安全一些，不是说这类药物就不需要皮试，而是对于一些人即使有类似于过敏的症状，这类药物对人体所产生的伤害也是很小的。
头孢类的抗菌谱更宽。青霉素一般只对革兰氏阳性菌有杀菌作用，对革兰氏阴性菌的作用比较小。但是头孢菌素对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌都有很强的杀菌作用，特别是头孢匹罗等这些第四代的头孢菌素。
头孢菌素类与酒精可产生双硫仑样反应。头孢哌酮、头孢哌酮舒巴坦、头孢唑林钠等因结构中含有甲硫四氮唑基团或甲硫三嗪侧链，服用这些药物后饮酒会发生双硫仑样反应，青霉素类无此反应。
对脏器相关的毒性不同。青霉素类比头孢菌素类毒性更低，第一代头孢有较大的耳毒性和肾毒性。
价格不同。青霉素类药物价格普遍比头孢菌素类低。
